Mr./Ms. Days (MMDays) - 網路, 資訊, 觀察, 生活

Posted By Mr. Thursday
下面的FLASH是由 Arthur Shapiro 所製作的視覺錯覺。原本固定形狀的花朵，加上邊緣的線條，就會開始規律地扭轉，好像在呼吸一樣呢！

FLASH1 呼吸的花
Arthur Shapiro會在他的blog每天製作一個視覺的錯覺 (Visual Illusion)。也許會納悶，怎麼人的視覺系統會產生錯覺呢？這樣子不就不大好？其實我們也可以說，因為人類視覺系統如此特別，所以可以輕鬆地辨識物體，尤其在切割兩個重疊的影像的時候，我們可以很輕鬆地把同一盤菜裡面的菜和湯分開來，如果要用電腦來處理，目前仍然無法很容易地進行。
其中部分原因，是因為我們的視覺系統是用對比的訊號 (contrast)，而不是像電腦的編碼，儲存的時候是用點陣圖的方式儲存，對比的資訊需要另外計算。電腦似乎就是用「絕對」的方式來處理視覺資訊，而人腦就是用一種「相對」的方式來處理視覺資訊，因此對電腦來說不容易的視覺工作，人腦是非常容易辦到，不過也因此會有副產品的產生，就是視覺上的錯覺了。之前曾經介紹的Ebbinghaus Illusion，就是可以說明我們使用相對資訊來處理視覺，因而產生錯覺的例子，您看！中間兩個圓圈是一樣大的，但是因為週遭圓圈大小不同，我們相對的視覺系統，就產生大小不同的錯覺了。

圖1 ebbinghaus illusion
除了「相對」的處理方式是人腦和電腦有所不同的地方，「平行計算」是另一個可以比較的地方。不過無論是電腦或是人腦，都會有平行計算，因此今天想探討的是另外一個問題，請各位先觀察一下下面這張圖片：

圖2 人腦XOR
這個圖片是由 Mark Changizi 所製作的，主要的想法是希望能夠利用人腦平行計算的能力，來解決一些邏輯上的運算。譬如說上面這張圖，是希望在圖的最上方可以放0或1，0的盒子會遠離觀賞者，1的盒子看起來會朝向觀賞者。接著觀賞著沿著這張設計好的圖，運用人腦的平行計算能力，看到圖片最下方的地方，如果感覺是朝向觀賞者，就說是1，如果最下面看起來是遠離觀賞者，就說是0。而這張圖的設計，可以讓觀賞者自然地從上面看到下面的時候，做了一個XOR (exclusive OR) 的運算。
不過我想探討的問題就是：平行計算應該是發生在運算初期的部分，無論是人腦還是電腦的平行計算。

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Posted By Mr. Thursday
電腦有電腦病毒，在生物體也有病毒。病毒和寄生蟲有類似的地方，就是他們都無法自行完成繁殖後代的過程，必須要找到宿主，才能產生下一代。病毒簡單地說，就是由 DNA 或 RNA組成一個病毒的中心，外面在包上幾層醣蛋白 (glycoprotein) ，就是一個病毒了，因為只有 DNA 或 RNA ，所以病毒容易突變，所以感冒疫苗比較少見，因為突變速度太快了。然而也因為病毒只有 DNA 或 RNA，因此他沒有一般生物體細胞裡面維持生命所需的胞器，像是之前介紹過的粒線體來提供能量，以及各式各樣的酵素來維持各種循環，以及最重要的，複製自己產生下一代。
因此，病毒組成非常簡單，就是DNA、RNA，外面包一層蛋白質就是了。

圖1 SARS病毒
現在剩下的問題，大概就是：DNA、RNA是什麼東西呢？之前DNA到蛋白質的過程這篇文章裡面，有簡單地介紹一下DNA、RNA、以及蛋白質之間的關係。在這邊我也簡短地複習一下，讓各位可以知道DNA，進一步知道病毒是什麼東西了！
當我們要學習一件新東西的時候，有個方法是讓新東西和過去學過的東西產生連結，譬如說視覺上，可以把以前學過可以辨識的特徵拿出來，變成現在新東西的面貌。譬如說我們可以把新東西切割，分析是由哪些我們已經知道的東西組成的。假如今天您從來沒聽過DNA、RNA，字面上我說DNA是deoxynucleic acid的縮寫，中文稱為去氧核糖核酸，可能你還是不知道這些字的意義。因此，先讓各位視覺上有個印象，分別看一下DNA和RNA的圖片：

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Posted By Mr. Thursday
石油價格和食品價格不斷上升，能源危機，無論是機器要用的石油、還是生物要用的食物，都慢慢顯現出來，除此之外，二氧化碳產生的溫室效應，也開始在氣候上面表現出來。面對這些危機，我們人類也開始有相對應的措施。太陽能發電，就是一種替代能源的方式，然而在研究太陽能發電之前，我們不妨也來看看，現在已經存在的太陽能發電，在生物上的模型，也就是植物的「葉綠體」了！葉綠體 (chloroplast) 是植物裡面負責將陽光，轉換成食物的地方。您看！自然界多麼巧妙！二氧化碳太多嗎？植物光合作用正需要它！能源危機嗎？植物的光合作用正是要產生糖類，之後無論是要當成食物、還是生質柴油 (diesel fuel)，都可以！唯一需要的，就是陽光、二氧化碳、和水，產出除了食物、水、還有呼吸需要的氧氣呢！這實在是太美好啦！就讓我們先來看看，葉綠體裡面是什麼樣子的作用，可以成為這麼好的太陽能發電廠呢？

圖1 光合作用流程圖
上面這張圖可以看到，光合作用需要二氧化碳 (CO2) 和 水(H2O)，下面則是有氧氣 (O2) 和 蔗糖 (sucrose) 。當然啦，還有最重要的太陽光在左上角。光合作用整個分成兩大部分，左手邊負責把太陽光的能量，轉換成電子的動能，用來產生細胞的能量貨幣 ATP ，右手邊則是把產生出來的 ATP 用來驅動右手邊的加爾文循環 (Calvin Cycle) ，產生蔗糖。如果讀者不大了解 ATP 是什麼，可以把ATP想像成細胞裡面傳遞能量的一種物質，就好像我們平常買賣會用錢幣或紙鈔一樣，ATP 就是一種細胞交易能量的貨幣。
 
圖2 葉綠體
接著，讓我們看看葉綠體的結構，葉綠體如上圖所示，裡面有許多綠色圓柱，是由一片一片類囊體 (thylakoid) 疊起來的。類囊體 (thylakoid) 和粒線體一樣，有內外兩層細胞膜。在粒線體: 細胞的發電機裡面我們曾經介紹動物把吃進去的食物，怎樣子透過粒線體，轉換成細胞交換能量的貨幣單位ATP，其中粒線體也是一個具有內外兩層細胞膜的胞器。
下面這張圖則是顯示葉綠體，在葉子裡面的哪個地方。左上角是葉子，右下角就是葉綠體。

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Posted By Mr. Thursday
由匹茲堡大學 (University of Pittsburgh) 和卡內基美隆大學 (Carnegie Mellon University) 的研究團隊所做的研究，把電極插到猴子的頭腦裡面，接著用電腦分析讀取電極傳出來的大腦訊號，轉換成機械手臂移動的指令，猴子便能夠用「想」的，移動機械手臂來自行拿取食物來吃。讓我們先看一下 DEMO 的影片。

這個研究如果將來技術成熟之後，可以應用在一些癱瘓病人身上。他們大腦裡面負責運動的區域可能還是好的，但是運動的肢體像是手臂等等，可能已經無法使用，這個時候就可以用機械手臂來取代，並且透過電及和電腦分析，讓使用者可以用意念，來指揮機械手臂。
目前比較困難的是，研究人員發現插進大腦的電極 (electrode) 在幾個月之後就會無法使用，因此這部分還有待突破。然而大腦運動區域訊號的分析，則是已經有顯著進展，只要先有一小段訓練時間，電腦就可以慢慢了解猴子移動手臂往上、往下、往前、往後、往左、往右、開始、停等訊號。
此外，我個人的觀察是，首先，因為運動神經在腦幹 (brain stem) 的區域會左右交換，因此影片中猴子右手一邊在動，但是我猜他們放置電極的地方可能是左腦的運動區。其次，運動訊號主要就是從大腦的主要運動皮質 (primary motor cortex) 區域裡面，負責手臂運動的地方的訊號來分析。不過不知道如果加上小腦 (cerebellum) 的訊號，會不會讓效果更好？因為小腦主要就是對運動進行微調，負責無意識的運動調節學習 (adapt)。
大腦的運動區域對身體的分佈，可以參考大腦一日遊裡面的這一張圖的說明：

左邊是主要感覺區的分佈，右邊是主要運動區 (primary motor cortex) 的分佈，臉部無論是感覺或是運動，都佔了很大的比例，代表對臉部的感覺和運動很細膩，需要比較大的區域來處理或產生訊號。另外，皮質區 (cortex) 是有意識的資訊的處理，訊號離開大腦後，會延著腦幹，往脊隨 (spinal cord) 的方向傳遞，中間會經過小腦，也會隨著訊息的目的地在不同的地方左右互換，這部分滿複雜，可能要重新複習一下課本才會記得，有興趣的讀者在繼續深究這一部分吧！

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Posted By Mr. Thursday

Google Earth現在可以觀賞迪士尼樂園 (Disney World) 的3D影像了。上面就是一部 DEMO 的影片。石油價格越來越高，機票越來越貴，沒辦法實體到迪士尼樂園玩，也可以先在 3D 虛擬世界裡面身歷其境一番，也是不錯的經驗！

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Posted by Mr. Thursday
在網路上看到一段教學影片，探討了一些投影片常見的錯誤，和大家分享，是一部5分鐘的短片，演講者也滿有趣的，影片有中文字幕。

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Posted By Mr. Thursday
有一家專門製作生醫動畫的公司 Hybrid Medical Animation 在2007年的時候贏得了 Aurora Awards。他們把各種醫學微觀現象作成電腦動畫，像是血管內的動畫、藥物殺死癌細胞的動畫、或是細胞分裂過程的動畫。動畫非常精美，也生動地描述了顯微鏡底下才看得到的各種細胞活動情形。下面就挑選幾個給各位先觀賞，有興趣的可以在他們的網頁觀賞更高畫質的 FLASH 影片。
第一部是贏得白金獎的影片(1分30秒)。

內容敘述一種藥物 Rexin-G，可以穿透癌細胞，並且攜帶特製的基因進入癌細胞，讓癌細胞啟動自我消滅的迴路 (Programmed Cell Death)。

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Posted By Mr. Thursday
不知道各位是否常常到Pubmed瀏覽論文paper，然後一篇一篇點選進去，再點選連結，再轉到期刊網站，才有一個PDF下載連結呢？現在 Pubget 這個網站，提供使用者Pubmed類似的查詢介面，但是特別的地方再於當你得到查詢結果的時候，連結點下去馬上就會出現論文PDF，不必再像以前慢慢點好多次才能下載paper，實在方便了不少。不過 Pubget 對於付費的期刊也是需要訂閱才找得到，因此如果所屬的研究機構沒有訂閱Pubget也沒關係，可以先看看下面這段DEMO望梅止渴一下！

參考資料

(Alt Search Engines) Pubget – Search for PDF’s without the hassle

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Posted by Mr. Friday
這篇文章要談的，就是今天TVBS斗大的新聞；
怒罵、毆打學生　老師暴力全被錄
桃園一所國中女老師，驚傳不只拿書本狂打學生的頭，甚至在盛怒之下，還推學生座椅打到學生，整個過程都被其他學生拿手機拍下來，放在網路上，引起討論；事後老師也出面，滿腹委屈，說學生對她嗆聲，她才罵人。…(中略)…
桃園這所國中的女老師，體罰學生的過程，全都被班上另一名同學拍下，放上網路，引起討論，老師卻很委屈。老師：「講義給我撕掉，考卷給我揉掉，對我嗆聲罵三字經，我的傷心難過就是，學生不能體會我的辛苦。」
儘管老師滿腹委屈，不斷為自己辯駁，但她的行為是否過當，已經引起主管單位的注意。
這則引起廣泛討論的新聞，便是來自於底下這位aeric5309的無名網誌影片

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Posted By Mr. Thursday

圖1 Melodyne聲音編輯軟體
喜歡創作音樂、編輯音樂的朋友有福啦！由Celemony Software公司的 Neubäcker 製作了一套軟體稱為 Melodyne，可以提供比一般音樂編輯軟體更為細膩的編輯方式。一般的音樂編輯軟體可以提供一些音效上的編輯，譬如說速度的變快變慢，譬如說音高的變高變低，譬如說聲音大小變大聲變小聲等等。然而目前這些軟體都是針對「整首曲子」來編輯，也就是說，是整首曲子節奏一起變快變慢，整首曲子音高一起變高變低，整首曲子一起變大聲變小聲。現在這個軟體，因為可以把一首曲子裡面每個音符，一個音符一個音符拆解開來，即使是同一個拍子出來的三個音符，也能夠拆解開來，因此就像上面那張圖一樣，變成一個二維的平面，橫軸是時間軸，縱軸是聲音高低，每一個音符的聲波拆解後就在平面上一個角落確定下來，等待使用者進一步編輯每一個音符。

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